Desde el año 2001 el instituto conforma la hoy llamada Fundación Instituto de Inmunología de Colombia - FIDIC-FIDIC cuyos objetivos globales siguen siendo el desarrollo de nuevas y mas eficaces vacunas contra la malaria y otras enfermedades trasmisibles así como de nuevos métodos diagnostico basados en péptidos, razón por la cual su objetivo actual se encamina al desarrollo de una nueva generación de vacunas contra la malaria a la cual se denominara COLFAVAC.

Este objetivo persigue la obtención y desarrollo de una vacuna conformada por múltiples componentes peptídicos derivados de proteínas provenientes de los estadios sexuales y asexuales del Plasmodium falciparum.

En el lapso de su historia científica la FIDIC, ha sido objeto de un amplio reconocimiento internacional en el campo del desarrollo de vacunas contra la malaria, lo cual se refleja en los más de 200 artículos publicados en revistas indexadas de alto impacto.

Así mismo la FIDIC, ha formado recurso humano a nivel doctoral contando con siete doctores graduados y ocho candidatos a doctor, así como también cinco graduados y cinco candidatos a la obtención del titulo de magister y por lo menos unos doscientos estudiantes de pregrado han realizado sus pasantías o tesis de grado en el instituto.